Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms