Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms