Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms