Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pm20d2A3KG59 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms