Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Btbd35f28A2CFD5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms