Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms