Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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