Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms