Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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