Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
2210011C24RikA0A087WQ89 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2210011C24RikA0A087WQ89 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
2210011C24RikA0A087WQ89 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
2210011C24RikA0A087WQ89 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2210011C24RikA0A087WQ89 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms