Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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PRKCHP24723 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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