Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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