Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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