Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IMPG1Q17R60 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms