Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt27Q9Z320 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms