Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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