Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms