Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms