Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp11cQ9QZW0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms