Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms