Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms