Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms