Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms