Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms