Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms