Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pold3Q9EQ28 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms