Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms