Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm50Q9D880 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms