Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrirQ9D735 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms