Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc3Q9D6Y1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms