Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms