Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
4933428G20RikQ9D3X4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms