Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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