Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms