Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx28Q9CWT6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx28Q9CWT6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx28Q9CWT6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx28Q9CWT6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx28Q9CWT6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ddx28Q9CWT6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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