Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms