Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT4

Mydgf, Myeloid-derived growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MydgfQ9CPT4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MydgfQ9CPT4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms