Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins4Q99LZ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms