Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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