Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms