Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ophn1Q99J31 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms