Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms