Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atpaf2Q91YY4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atpaf2Q91YY4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms