Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms