Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms