Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms