Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colec12Q8K4Q8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms