Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms