Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem17Q8K0U3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem17Q8K0U3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms