Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms